卫生部6月21日在成都召开地震灾后恢复重建卫生对口支援工作会议。卫生部部长陈竺在会上要求，支援省（市）卫生行政部门和受援地卫生行政部门要相互配合，通力协作，确保在2008年底前全部完成卫生部提出的灾区卫生系统恢复重建4个既定工作目标。其中首要任务就是帮助地震灾区尽快恢复医疗卫生服务体系，要尽快推进灾区县、乡（镇）医疗卫生服务体系建设。

卫生部6月17日在京召开了全国卫生厅局长会议，贯彻落实中央会议精神，提出了灾区卫生系统恢复重建工作四步走的目标：第一步是到今年6月底，各医疗卫生防疫队，要按照中央确定的对口支援方案，完成“交接换防”任务，做好调整与对接工作。第二步是到7月底，在对口支援省市支持下，灾区县、乡（镇）和受灾群众安置点普遍建立医疗卫生服务体系，开展基本医疗和卫生防疫工作。第三步是到9月底，全面完成灾区县、乡（镇）的临时医疗卫生机构建设，基本恢复灾区正常医疗卫生服务秩序。第四步是到今年底，灾区医疗卫生服务体系全面恢复，临时业务用房、基本设备和技术人员配备比较齐全，能够全面开展正常医疗卫生服务工作，确保不发生重大传染病疫情。

陈竺要求，各支援省（市）卫生行政部门要尽快确定支援的规模、结构和分布，落实好各项任务和措施。要制订工作计划、明确工作目标、加强人员培训、购置必要设备、加大技术支持。要按照当地医疗卫生工作需要，合理调配援助力量，进行有机的资源整合，充分发挥作用。各受援地政府及卫生行政部门要在总结前期抗震救灾医疗卫生工作基础上，根据灾后卫生防病工作形势和灾后恢复重建医疗卫生工作需要，与对口支援省（市）加强沟通，整合医疗卫生资源，合理安排支援省（市）医疗卫生队伍布局。