5月31日上午10时，在成都火车北站开出了一列发往福建的专列，运送近300名地震伤员到漳州、厦门进行救治。卫生部部长陈竺在四川省、铁道部等有关领导陪同下，专程到成都火车北站检查指导四川地震伤员转运工作。

从5月17日至31日，通过21次专列、99架包机以及万余次救护车，出动医务人员5000余人，从四川地震灾区向北京、天津、河北、山西、辽宁、上海、江苏、浙江、安徽、福建、山东、河南、湖北、湖南、广东、广西、重庆、贵州、云南、陕西等20个省（区、市）340多家三级医院转送地震伤员近万名，为最大限度改善地震伤员治疗条件、保护伤员健康、分散四川省医疗压力、推进恢复重建创造了有利条件。据了解，这次四川地震灾区伤员转运工作是党中央、国务院作出的重大决策。在四川省委、省政府的坚强领导下，在铁路部门和民航部门的全力支持下，全国卫生系统总动员，精心组织，力保伤员安全；铁道部组织多个路局协同配合，一站到达；民航部门组织国航、川航、东航、深圳航空、鹰联航空等航空公司和多个机场紧密配合，创造了我国医疗卫生史上新的奇迹，为我国乃至世界的救灾防病工作提供了全新的经验。