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北京大学医学网络教育学院成立于 2000 年 10 月 10 日，隶属于北京大学医学部，是实施医学远程教育的实体学院。 2001 年 9 月 16 日，北京大学医学网络教育学院正式开学，招收了第一批学生。学院依托北京大学雄厚的师资力量和优秀的教育资源，具有医学学科门类齐全，相关教育层次完整，教学经验丰富的基础。学院充分利用现代卫星通讯技术、计算机技术、网络技术等先进手段独立开展具有自身特色的医学远程教育。
为了不断探索医学远程教育的教学模式，提高教学效果和学习效率，北京大学医学网络教育学院通过下列方式开展教学：
（ 1 ）在学院统一指导下，学生利用多媒体课件和文字教材进行自主学习；
（ 2 ）通过互联网教学平台完成选课、学习、作业、答疑、交流、约考等各种教学活动。
（ 3 ）组织学生收看中国教育电视台 DVB 卫星频道广播视频录像课程；
（ 4 ）通过 IP 卫星频道传送网络课件及主讲教师的串讲或辅导录像；
目前，学院已自主完成 139 门教学课程的设计制作，网络教学课程提供率达到了 100% 。在学习过程中，学院为学生自主学习提供了多种服务方式：每学期开学前，学院将本学期学生所需要的教材、光盘等学习资料以教学包的形式邮寄给当地教学中心，由教学中心分发给学生；通过网络教学平台进行网上辅导答疑、讨论和交流；通过 email 、热线电话、短信等通讯媒介建立师生交流渠道；通过视频会议系统进行实时答疑等。此外，期末考试前的串讲、复习指导和教学中心的面授辅导等环节也进一步保证了学生学习质量的提高。考核依课程性质的不同，分考试和考查，采用统一卷面考试和网上随机考试相结合的方式，灵活而富有弹性，充分体现了学分制的优越性。
2003 年，为适应经济发展和社会进步对医学远程教育的要求，学院对教学模式进行了重大改革，在医学网络教育中逐步推行学分制，进行灵活、富有弹性的教学组织和管理。为了配合学分制的推行，在吸收国内外学分制管理经验及总结网络学院三年教学和教务管理需求的基础上，学院于 2004 年 7 月独立设计开发完成了新的教学教务支撑平台。新平台不仅具有强大的管理功能，而且其先进性、灵活性、逻辑性、安全性、开放性等特点在使用中都得到了充分的展现，为学分制管理提供了强大的技术保障。
在办学实践中，北京大学医学网络教育学院十分注重对学生综合素质及创造性思维能力的培养，积极推进校园文化建设，真正做到以学生为关注焦点，建立了学生跟踪服务体系，为学生提供了优质、高效的服务，取得了良好的教学效果。
先进灵活的管理体制是北京大学医学网络教育学院快速发展的根本动因，学院实行的是企业化运作的管理模式，下设 8 个职能部门，即：院办、财务室、教学部、学习支持部、北京教学中心、技术部、招生办、市场部；共有教职员工 50 余人，其中本、专科学历人员占全体员工总数的 72.5% ，研究生以上占 21.5% 。
2002 年 3 月学院正式导入了 ISO9001 ： 2000 标准质量管理体系，并于 2003 年 3 月 28 日成功通过了 ISO9001:2000 质量管理体系认证，成为全国首家通过 ISO9001 ： 2000 质量管理体系认证的远程教育机构。导入 ISO9001 ： 2000 标准的过程，使学院在教育观念、办学理念、服务意识、管理水平诸方面取得跨越式的进步。学院管理层既远见卓识又务实创新，尊重员工的首创精神，以员工的真正需求为出发点，在全院逐渐建立起一支 “ 以精神为灵魂、以制度为依托、以形象为载体 ” 的优秀团队。
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